생물 다양성의 중요성 심화 탐구

1 생물 다양성

생물 다양성의 의미: 생물다양성이란 지구의 다양한 환경에 다양한 생물이 살고 있는 것을 의미하며, 생물종의 다양함 뿐만 아니라, 각각의 생물종이 가지는 유전 정보의 다양함, 생물과 환경이 상호 작용하는 생태계의 다양함까지 모두 포함한다.

⑴ 유전적 다양성

① 같은 생물종이라도 각 개체가 서로 다른 대립유전자를 가져 각 개체 사이에 형질이 다르게 나타나는 것. 종 내에 다양한 대립유전자가 있으면 유전적 다양성이 높다.

예) 아시아무당벌레의 다양한 색과 반점 무뉘, 기린의 다양한 털 무늬 등

② 유전적 다양성의 이점

- 한 개체군이 오랜 시간에 걸친 진화 과정으로 출현한 다양한 유전 정보를 보유할 수 있도록 한다.

- 따라서 변화하는 환경에 적응할 수 있고, 질병에 대한 저항성을 획득할 수 있는 새로운 자손이 태어날 수 있게 한다.

③ 유전적 다양성이 우리 생활에 주는 이점

- 새로운 형질을 가진 우수한 농축산물을 생산하는 데 활용

- 다양한 미생물 유전자를 이용하여 신약 개발 가능

- 유전적 다양성은 농작물의 품종 개량에도 도움을 준다. 유용한 유전자를 지닌 야생 식물 종으로부터 얻은 유전자를 이용해 생산성을 높고 질병에 강한 농작물을 가발하기도 한다.

⑵ 종 다양성

① 한 지역 내에 존재하는 생물종의 다양한 정도

② 종의 수가 많을수록, 전체 개체 수에서 각 종이 차지하는 비율(종의 비율)이 균등할수록 종 다양성은 높다.

③ 종 다양성이 높을수록 생태계가 안정적으로 유지된다.

⑶ 생태계 다양성

① 지구상에 존재하는 생태계의 다양함을 의미

② 삼림, 초원, 사막, 습지, 호수, 강, 바다 등의 다양한 생태계가 존재

③ 생태계의 종류에 따라 환경 요인, 서식하는 생물 종류와 수, 생물 사이의 상호 작용이 서로 다르게 나타난다.

④ 갯벌, 습지: 두 생태계가 인접하여 두 생태계의 자원을 이용하는 생물종이 공존할 수 있어 높은 종 다양성을 보인다.

Biodiversity

https://en.wikipedia.org/wiki/Biodiversity

Biodiversity: Concepts, Patterns, Trends, and Perspectives

https://www.annualreviews.org/doi/abs/10.1146/annurev-environ-120120-054300

일부 번역입니다.

현재 과학, 정책, 더 넓은 사회에서 널리 사용되는 용어인 생물다양성은 관련 문헌이 급증하고 있습니다. 우리는 몇 가지 주요 개념, 논쟁, 패턴, 추세 및 동인에 초점을 맞춰 이 문헌의 측면을 종합합니다. 우리는 용어의 역사와 생물다양성의 다양한 차원과 가치를 검토하고, 생물다양성의 글로벌 패턴에 대해 알려진 것과 알려지지 않은 것을 탐구합니다. 그런 다음 초기 인류 시대부터 현대 시대까지 생물 다양성의 변화를 검토하고 멸종 속도와 생물 다양성 변화의 직접적인 동인을 조사하고 잘 연구되지 않은 일부 동인을 강조합니다. 마지막으로, 우리는 전 세계 생물다양성 손실의 간접적인 요인, 특히 인류의 전 세계 소비 발자국 증가에 관심을 돌리고 지구상 생명체 구조의 지속적인 감소를 되돌리기 위해 무엇이 필요할 수 있는지 탐구합니다.

  1. 인간과 생물다양성 추세

5.1. 전근대 시대의 인간과 생물다양성 변화

사회적 거대동물군 잡식성 포식자이자 경쟁자인 호모 속의 종은 그들이 거주하는 생태계의 생물 다양성에 항상 영향을 미쳤을 가능성이 높습니다. 실제로, 다양한 환경 틈새 시장을 구축하는 능력(55,56)는 Homo 의 핵심 속성입니다 . 인간의 생물군 형성은 홍적세에 사냥, 다른 종의 이동, 불의 사용을 통해 시작되었습니다.55,57–59) 그리고 약 12,000년 전인 홀로세(Holocene)가 시작될 무렵에는 이미 육상 생태계의 약 3/4에 사람이 살고 있었습니다(60). 호모 에렉투스 의 출현 , 더 큰 뇌 크기, 더 많은 육류 기반 식단으로의 전환, 생태계를 수정하고 식품을 요리하기 위한 전략으로 불을 사용하는 것과 관련된 일부 종의 멸종이 일어났을 수 있다는 증거가 있습니다. 아프리카에서는 100만~200만년 전(61). 더욱 놀라운 증거는 호모 사피엔스가 아프리카를 벗어나 대륙과 섬을 가로질러 퍼진 것과 느슨하게 연관된 거대동물의 멸종에서 드러납니다. 척추동물 거대동물(질량 44kg 이상)은 느린 생성 시간과 넓은 범위 요구 사항으로 인해 대륙에서 특히 취약한 것으로 나타났습니다.58). 홍적세 거대동물 멸종에서 인간의 역할은 여전히 ​​논쟁의 여지가 있는데, 부분적으로는 어느 한 지역에서 인간 존재에 대한 빈약한 고고학 기록을 다른 가능한 환경 요인과 확실히 분리하기 어려울 수 있기 때문입니다. 그러나 전 지구적인 상황을 고려할 때, 인간의 도착이 많은 종의 손실과 연관되어 있으며, 어떤 경우에는 대규모 동물군 개체군에 단기적인 압력을 가하는 기후 변화와 연관되어 있다는 사실을 부인하기 어렵습니다.62–64). 이 주장은 홍적세 전반에 걸쳐 대규모 거대동물의 멸종을 일으키지 않고 기후가 빙하에서 간빙기 조건으로 변동했다는 점을 고려할 때 더욱 강화됩니다. 총 178종의 거대동물 포유류가 후기 홍적세 멸종 때 멸종된 것으로 생각됩니다.64). 대륙 전체에서 유라시아는 28종의 거대 동물군 중 9종을 잃은 것으로 추정됩니다. 호주, 16개 중 14개; 북미, 60개 중 50개; 및 남아메리카, 47개 중 34개. 아프리카는 영향을 가장 적게 받는 대륙이었으며, 그 이유를 추측하는 것은 흥미롭습니다(65). 가장 빈번한 주장은 그곳의 종(그리고 그 정도는 덜하지만 남부 유라시아)이 인류와 공진화하여 포식자로서의 잠재력을 두려워하는 법을 배웠다는 것입니다. 반면 다른 대륙의 종은 이 작은 영장류가 제시하는 위협에 생태학적으로 순진했습니다. 그러나 몇몇 거대 동물종(예: 장비목)은 높은 행동 및 사회적 지능을 보여주며 새로운 위협에 대응하여 빠르게 학습할 것으로 예상됩니다. 대안적이거나 보완적인 주장은 아프리카가 홍적세의 200만 년 동안 계속되는 인류의 물결로 인해 오랫동안 지속된 거대동물군 쇠퇴를 경험했다는 것입니다. 레반트 남부의 최근 연구에 따르면 호모 에렉투스 , 호모 네안데르탈렌시스 , 호모 사피엔스 의 점령을 거치면서 홍적세 전반에 걸쳐 대형 포유류 바이오매스가 꾸준히 감소하는 것으로 나타났습니다 . 10,500년 전까지 포유류 유해의 평균 바이오매스는 150만년 전에 발견된 것의 1.5%에 불과했습니다.66). 대형 동물이 영양 순환과 같은 생태계 구조와 기능을 형성하는 데 중요한 역할을 하기 때문에 이러한 확장의 영향은 종 자체를 넘어 확장될 가능성이 높습니다.67,68).

5.2. 현대 생물 다양성 감소

현대에 들어 생물다양성 감소 속도가 더욱 심해지고 있다. 오늘날 세계적으로 지배적인 인간의 자연 전유 모델을 정의하는 몇 가지 특징은 이미 근대 이전에도 존재했습니다. 그러나 세계화와 경제적 중상주의의 단계적 변화와 동시에 그 규모는 극적으로 증가했습니다.80): 16세기 초 아메리카 대륙과 기타 식민지 지역에 대한 유럽인의 착취의 시작, 18세기 말과 19세기 초의 산업 혁명, 그리고 대가속(81) 1950년대 이후. 그 결과, 자연 생태계의 범위와 완전성, 지역 공동체의 특수성, 식물과 동물 개체군의 규모와 지리적 확산, 종의 수, 야생 및 가축 유기체의 종내 유전적 다양성이 모두 감소했습니다(5,33). 이러한 감소는 대중의 관심을 덜 받은 다른 두 가지 글로벌 프로세스를 동반했습니다. 생물학적 균질화라고 불리는 첫 번째 과정은 인간에 의한 고의적이거나 비자발적인 유기체 이동으로 인해 전 세계 지역 생물군의 분류학적, 기능적, 계통발생적 및 종 풍부성 특성이 감소하는 것으로 구성됩니다.82,83); 지구 생물지리학의 이러한 정도 재편성은 Harold A. Mooney에 의해 신판게아(New Pangea)로 불렸다.84). 예를 들어, 지난 5세기 동안 식물군집의 균질화가 널리 이루어졌으나 이는 토착종의 멸종보다는 종들이 토착 범위를 넘어 귀화한 결과에 훨씬 더 가깝습니다.85).

두 번째로 널리 퍼진 과정은 동시대 진화, 즉 야생 개체군에서 진행 중이거나 최근에 유전되는 표현형 변화입니다.86,87) 사냥, 어업, 도시화, 농업용 살생물제 사용, 운송 또는 관개 인프라 개발과 같은 인간의 방향 선택 압력의 결과로 발생합니다. 이러한 압력은 표현형 변화가 예를 들어 선택적 육종과 달리 원하는 활동 목표라기보다는 부수적인 효과라는 점에서 대부분 의도되지 않은 것입니다. 지난 몇 년 동안 사례의 수가 증가했습니다(33,88,89), 아마도 현대 진화 자체의 가속화보다는 관심의 변화 때문일 것입니다. 인간에 의해 유전자에서 생물군계에 이르기까지 모든 수준에서 지구상의 생명체가 전 세계적으로 재구성되면서 생태학적, 철학적, 정책 분야에서 풍부한 논의가 촉발되었습니다.5,15,80,90,91).

5.2.1. 멸종 위험 및 비율.

우리 행성이 빠르게 종을 잃고 있다는 사실은 과학자들에게 잘 알려져 있으며 더 많은 대중에게 가장 잘 알려진 자연 쇠퇴의 한 측면입니다. 이 때문에 종 수준에서 생물다양성 상태를 조사하려면 종과 고차 분류군의 수, 지리적 분포, 풍부함뿐만 아니라 인간과 관련된 시간 규모에서 사라질 위험도 포함되어야 합니다. 종 수준에서 세 가지 종류의 멸종이 관련됩니다. 갑자기 지구상에서 종을 멸종시키는 재앙적인 멸종 사건이 발생하는 반면, 대부분의 멸종은 다소 점진적으로 발생합니다. 이는 일부 지역에서 종이 점점 희귀해질 때 시작되며, 개체수는 장기적으로 지속될 수 있을 만큼 여전히 높지만 종의 생태학적 역할 중 일부를 완전히 수행하기에는 너무 작습니다. 이를 기능적 소멸이라고 합니다(92). 두 번째 종류는 국지적 멸종으로, 한 종이 해당 범위의 일부에서는 멸종되었으나 다른 지역에서는 지속되는 경우입니다. 예를 들어, 사자( Panthera leo ), 구아나코( Lama guanicoe ), 들소( Bison bison )는 오늘날 이전 분포 범위의 작은 부분을 차지하고 있습니다. 마지막으로, 어떤 종이 ​​지구에서 사라질 때 전 세계적으로 멸종되었다고 합니다. 처음 두 종류는 의심할 여지 없이 중요하지만, 대부분의 전지구적 모니터링 노력과 그에 따라 발표된 대부분의 정보는 전지구적 멸종을 다루고 있으며, 이에 대해서는 이 섹션의 나머지 부분에서 논의합니다. 지구적 멸종을 언급하는 가장 일반적인 두 가지 방법은 멸종 위험과 멸종 속도입니다. 이러한 보완적인 지표는 멸종 과정에 대한 다양한 통찰력을 제공합니다.

5.2.2. 여섯 번째 대량멸종 사건?

진행 중인 여섯 번째 대량 멸종에 대한 언론 보도가 널리 퍼져 있습니다(즉, 현재의 멸종 규모와 속도가 지구 역사상 다섯 가지 주요 멸종 사건에 대해 추정된 것과 유사한지 여부). 대량멸종은 지질학적으로 비교적 짧은 기간에 생물종의 75% 이상이 사라지는 것을 기술적으로 정의합니다. 문제는 ‘짧다’는 정의가 쉽지 않다는 것입니다. 멸종 사건의 기간은 소행성 충돌의 경우 수년부터 강화된 화산 활동의 경우 수백만 년까지 다양합니다. 따라서 관찰된 멸종 규모가 여전히 대량 멸종 사건의 한계점과는 거리가 멀다고 결론짓기는 쉽지만, 비율을 비교하기는 더 어렵습니다. Barnosky와 동료들(98)는 현재의 멸종 속도로 인해 5번의 대량 멸종에 해당하는 포유류, 조류, 양서류 종의 손실이 발생하는 데 얼마나 오랜 시간이 걸릴지 계산했습니다. 비관적 시나리오(현재 위협을 받고 있는 모든 종은 100년 이내에 멸종됨) 또는 낙관적 시나리오(심각하게 멸종 위기에 처한 종만 향후 500년 내에 멸종됨)를 가정하는지 여부에 따라 멸종률은 2~3년 내에 대량 멸종 규모에 도달할 것입니다. 수세기 또는 10,000년 또는 그 이상. 오늘날 우리가 보고 있는 것이 기술적으로는 여섯 번째 대량 멸종에 해당하지 않지만, 우리가 멸종 위기에 처해 있는지 여부는 우리가 인간적 시간 척도로 생각하는지 지질학적 시간 척도로 생각하는지, 그리고 종의 보존 상태를 개선하는 데 성공했는지에 달려 있습니다. 그러나 이러한 기술적 문제, 불일치 및 불확실성으로 인해 ( a ) 현재 멸종률이 인류 역사상 어느 시점의 평균보다 높다는 사실이 가려져서는 안 됩니다 . ( b ) 향후 몇 세기 동안의 대량 멸종 규모의 종 손실을 배제할 수 없습니다. 그리고 ( c ) 대량 멸종은 냉혹한 과정과는 거리가 멀다. 인간의 행동은 그러한 멸종 속도에 도달하는지 여부에 극적인 변화를 가져올 수 있다.

2 생물 다양성 보전

생물 다양성 감소 원인

⑴ 서식지 파괴와 단편화

① 서식지 파괴: 생물 다양성을 위협하는 가장 큰 요인이다. 인간의 주거 지역, 경작지확보, 벌목 등으로 인해 서식지가 파괴되고 있다.

② 서식지 단편화: 철도, 도로 건설 등으로 인한 서식지 단편화는 서식지 면적을 줄이고 생물의 이동을 제한하므로 개체군의 크기가 줄어들어 멸종으로 이어질 수 있다.

③ 서식지 단편화 또는 고립화 문제를 해결하기 위해 도로 등을 건설할 때 생태 통로를 설치할 수 있다.

⑵ 환경 오염

인간 활동으로 인한 쓰레기, 폐수의 증가, 비료와 농약의 사용, 대기 오염 등으로 생태계가 파괴되고, 생물 다양성을 감소시킨다.

⑶ 남획

야생 동물과 희귀 식물의 불법 포획, 남획은 생물의 개체 수를 감소시키고 먹이 사슬을 파괴하여 다른 종의 생존까지 위협할 수 있다. 예) 상어의 남획

⑷ 외래 생물 도입

① 외래 생물: 원래 살던 곳을 벗어나 다른 지역으로 이주하여 생활하는 생물

② 외래 생물이 도입된 곳에 그들의 천적이 존재하지 않는 경우 기존의 고유종을 멸종시키거나 생태계를 교란시킨다.

③ 우리나라에 도입되어 생태계에 악영향을 준다. 예) 뉴트리아, 큰입배스, 황소개구리, 가시박, 돼지풀 등

생물 다양성 보전 대책

모든 생물은 생태계 내에서 다른 생물과 다양한 관계를 맺고 살아가며 고유의 기능을 수행하고 있다. 생물 다양성 보전을 위해 멸종을 방지하고 생물 다양성 감소 요인을 줄여야 한다.

⑴ 생물 다양성 보전 이유

① 생물 다양성은 인간을 비롯한 모든 생명체가 살아가기 위한 필수 조건이다.

② 모든 생물은 인간과 함께 생명권을 가지는 생태계의 동등한 구성원으로서 생존할 권리를 갖는다.

③ 생물 다양성의 감소는 인류가 이용할 수 있는 자원의 종류를 감소시킨다.

https://simagebank.com/wp/599/

항생제 내성 진화-과학 심화 탐구

항생제는 어떻게 작용할까?

박테리아에 대한 항생 물질은 박테리아를 공격하고 우리 몸의 세포는 공격하지 않는 특징이 있다. 그 이유는 항생제가 박테리아에게만 있는 효소나 구조를 공격하기 때문이다. 즉, 진핵생물의 리보솜과 다른 구조를 가진 박테리아의 리보솜을 표적으로 스트렙토마이신 등의 항생제가 작용한다. 또한, 진핵세포의 세포벽과는 다른 구조를 갖는 박테리아 세포벽은 페니실린이나 반코마이신에 의해 합성이 억제된다.

항생제 내성균-슈퍼박테리아

오늘날 어떤 항생제로도 잘 죽지 않는 박테리아들(슈퍼박테리아)이 많이 발견되고 있다. 항생제가 있는 환경에서 계속 미생물을 키우면 자연 선택 때문에 항생제 내성균이 우점종이 될 수밖에 없다. 그런데 실제로 손 세척 비누, 세탁세제, 동물, 축산농가 심지어는 과수나무에도 항생제가 남용되고 있으므로 항생제 내성균이 많아지는 것이다.

박테리아의 항생제 내성

https://simagebank.com/wp/298/

Antibiotic Resistance in Bacteria-A Review

https://www.mdpi.com/2079-6382/11/8/1079

배경: 박테리아 간의 다제 내성(MDR)의 세계적인 문제는 매년 수십만 명의 사망 원인입니다. MDR 박테리아의 상당한 증가에 대응하여 가축용 사료 첨가제의 형태뿐만 아니라 2019년 6월 EU 규정의 대상이었던 메타필락시스 및 그 치료를 포함하여 항생제의 사용을 제한하거나 제거하기 위한 입법 조치가 널리 취해졌습니다. 수많은 연구에서 박테리아가 표현형과 유전 전략을 모두 사용하여 항생제에 대한 자연 방어를 가능하게 하고 사용된 항균 화학 물질에 대한 내성을 증가시키는 기전을 유도한다는 것을 문서로 만들었습니다. 이 검토에서 제시된 기전은 인간과 동물의 박테리아 감염과 싸우는 능력을 줄이는 데 큰 영향을 미친다. 또한, 환경에서 다중 내성 균주의 높은 유병률과 공생 식물상 및 식인성 병원체와 같은 병원성을 포함한 다른 박테리아 종 간의 약물 내성 유전자의 전달 용이성(대장균, 캄필로박터 종, 엔테로코커스 종, 살모넬라 종, 리스테리아 종, 포도상구균 종.) 인간과 동물의 박테리아 사이에 다중 저항의 급속한 확산을 선호합니다. 인간과 동물에게 위험한 박테리아 사이에 다중 약물 내성의 광범위한 현상으로 인한 세계적인 위협을 감안할 때, 이 연구의 주제는 인간과 동물로부터 분리된 “식인성 병리학자”라고 불리는 가장 빈번한 박테리아에서 내성 기전을 제시하는 것입니다. 선택된 병원체, 특히 인간에 대한 위험 중 다제 내성과 관련된 글로벌 문제의 중요성을 제시하기 위해이 간행물은 또한 세계 여러 지역에서 선택된 박테리아 중 약물 내성 발생 비율 범위에 대한 통계 데이터를 제시합니다. 병원체 내성의 표현형 특성 외에도 이 검토는 특정 항생제 그룹에 대한 약물 내성 유전자 검출에 대한 자세한 정보를 제공합니다. 원고는 또한 Campylobacter spp., E. coli 또는 Enetrococcus spp와 같은 자체 연구 결과를 제시한다는 점을 강조해야합니다. 이 주제와 박테리아 간의 약물 내성 위험에 대한 데이터 제시는 약물 내성 예방 및 박테리아 제어의 항균 방법에 대한 대안 개발을 구현하는 연구를 시작하는 데 기여할 것입니다.

농업에서의 항생제 사용은 약물 내성 두려움에도 불구하고 급증할 것입니다.

https://simagebank.com/wp/73/

Antibiotic use in farming set to soar despite drug-resistance fears

https://www.nature.com/articles/d41586-023-00284-x

분석에 따르면 항생제 내성의 주요 원인인 동물 사육에서의 항생제 사용은 사용을 줄이기 위한 지속적인 노력에도 불구하고 2020년에서 2030년 사이에 8% 증가할 것으로 예상합니다.

농업에서 항생제의 남용은 항생제로 치료할 수 없는 박테리아 감염의 인간 증가의 주요 동인으로 생각됩니다. 항생제는 가축의 감염을 치료하는 데 필요할 수 있지만, 종종 동물의 성장을 가속하고 붐비고 비위생적인 환경에서 동물의 질병을 예방하는 데 사용됩니다.

많은 정부가 항생제 사용을 줄이기 위한 규칙을 만들거나 시행하기 위해 고군분투하고 있습니다. 예를 들어, 미국과 유럽의 많은 부분을 포함한 많은 국가에서 성장을 촉진하는 항생제의 사용을 금지하지만, 제조업체는 질병을 예방하기 위해 약물을 마케팅하고 있다고 말할 수 있습니다.

파지 요법: 생물학적 메커니즘에서 미래 방향으로

https://simagebank.com/wp/126/

Phage therapy: From biological mechanisms to future directions

https://www.cell.com/cell/fulltext/S0092-8674(22)01461-1

항생제 내성 비율이 증가함에 따라 100년 전에 발견된 박테리아의 자연 포식자인 박테리오파지 (파지) 연구가 활성화되었습니다. 파지를 치료적으로 사용하기 위해서는, 이들은 (1) 바람직하게는 용균이고, (2) 박테리아 숙주를 효율적으로 죽이고, (3) 부작용을 배제하도록 완전히 특성화되어야 한다. 치료 파지를 개발하려면 여러 이해 관계자의 공동 노력이 필요합니다. 본원에서, 우리는 파지 요법의 최신 기술을 검토하여, 생물학적 메커니즘, 임상 적용, 나머지 과제, 및 자연 발생 및 유전자 변형 또는 합성 파지를 포함하는 미래 방향을 다룹니다.

2022년에 항생제 내성(AMR)의 글로벌 건강 영향에 대한 첫 번째 종합 평가에서는 2019년에 4.95백만 명이 AMR과 관련이 있으며 1.2백만 명이 직접 기인하는 것으로 추정되었습니다. 이러한 사망 대부분은 저소득 및 중간 소득 국가에서 발생했으며 4분의 3은 이전에 세계 보건기구 (WHO)에서 우선 병원체로 확인된 6종의 박테리아에 의해 발생했습니다. 이 보고서는 이환율, 사망률 및 장애에 대한 AMR의 규모가 적어도 인간 면역 결핍 바이러스 및 말라리아의 규모만큼 크다는 것을 확인했지만 AMR의 발병률은 COVID-19 대유행 기간 크게 악화하였습니다.

숙주 관련 미생물군집의 멀티스케일 진화 역학

https://simagebank.com/wp/112/

Multiscale Evolutionary Dynamics of Host-Associated Microbiomes

https://www.cell.com/cell/fulltext/S0092-8674(18)30159-4

미생물총의 복합 구성원은 다양한 선택적 압력에 직면하며 숙주에서 지속하도록 적응해야 합니다. 우리는 생물학적 및 비생물적 섭동에 대한 탄력성을 가능하게 하는 숙주 관련 미생물 총의 중첩된 규모에 걸쳐 유전 정보의 진화와 전달을 특성화하는 최근 연구를 강조합니다. 균주 수준에서 우리는 자손 계통에서 적응 정보의 보존 및 다양화를 고려합니다. 지역 사회 수준에서 우리는 생태계에서 별개의 미생물 간의 유전 적 교환을 고려합니다. 마지막으로, 우리는 미생물 군집을 외부 미생물의 침입을 통해 외부 생태계에서 새로운 정보를 습득할 수 있는 개방형 시스템으로 구성합니다.

https://www.cell.com/cms/attachment/44cc2e49-6897-4a10-8475-1d4b0dedd7c2/gr1.jpg

강력한 경구 항결핵제로서의 천연 제품 유래 세쿼나마이신의 발견

https://simagebank.com/wp/105/

Discovery of natural-product-derived sequanamycins as potent oral anti-tuberculosis agents

https://www.cell.com/cell/fulltext/S0092-8674(23)00102-2

하이라이트

구조 기반 의약 화학은 최적화된 세쿼나마이신 유래 선도 분자인 SEQ-9로 이어집니다.

세쿼나마이신은 고유한 Mtb 마크로라이드 내성을 극복할 수 있는 마크로라이드 항생제입니다.

SEQ-9는 Mtb 리보솜의 메틸화 (내성) 형태에 대한 결합 모드를 조정할 수 있습니다.

SEQ-9는 시험관 내에서 Mtb를 죽이고 결핵 마우스 모델에서 효과적입니다.

요약

약물 내성 결핵의 출현으로 새로운 항결핵제가 절실히 필요하게 되었습니다. 여기에서 우리는 결핵균(Mtb)에 대한 뛰어난 체외 및 생체 내 활성을 가진 세쿼나마이신이라고 하는 일련의 마크로라이드의 발견을 보고합니다. 세쿼나마이신은 에리스로마이신 및 클라리스로마이신과 같은 고전적인 마크로라이드와 유사한 방식으로 리보솜과 상호 작용하는 박테리아 리보솜 억제제이지만 Mtb의 고유한 마크로라이드 내성을 극복할 수 있는 결합 특성이 있습니다. 결합한 억제제를 갖는 리보솜의 구조는 고급 선도 화합물 SEQ-9를 생산하기 위해 세쿼나마이신을 최적화하는 데 사용되었습니다. SEQ-9는 단일 제제로서 급성 및 만성 결핵의 마우스 모델에서 효과적이었으며, 다른 결핵 약물과 함께 쥐 결핵 감염 모델에서 살균 활성을 입증했습니다. 이러한 결과는 약물 감수성 및 약물 내성 결핵에 대한 새로운 요법에 사용될 가능성과 함께 결핵 임상 후보로서 이 시리즈에 대한 추가 조사를 뒷받침합니다.

An overview of the antimicrobial resistance mechanisms of bacteria

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6604941/

항균제에 대한 내성은 전 세계적으로 이환율과 사망률의 주요 원인이 되었습니다. 1900년대에 항생제가 처음 소개되었을 때 우리는 미생물과의 전쟁에서 승리했다고 생각했습니다. 그러나 미생물이 사용된 모든 약물에 대한 내성을 발달시킬 수 있다는 사실이 곧 발견되었습니다. 분명히 대부분의 병원성 미생물은 적어도 일부 항균제에 대한 내성을 발달시키는 능력을 가지고 있습니다. 저항의 주요 기전은 약물의 흡수 제한, 약물 표적의 변형, 약물의 불활성화 및 약물의 활성 유출입니다. 이러한 기전은 미생물 고유의 것일 수도 있고 다른 미생물로부터 얻은 것일 수도 있습니다. 이러한 메커니즘에 대한 더 많은 이해는 감염성 질환에 대한 더 나은 치료 옵션으로 이어지기를 바랍니다.

Antimicrobial Resistance (AMR)

https://www.frontierspartnerships.org/articles/10.3389/bjbs.2023.11387/full

항균제 내성(AMR)은 현재 전 세계적으로 만성적인 공중 보건 문제로 부상하고 있으며 2050년까지 전 세계적으로 연간 1천만 명이 사망할 것으로 예상됩니다. 따라서 숙주 내에서 미생물의 생존을 허용합니다. 현재 위기에 기여하는 두드러진 원인은 항생제의 남용과 오용, 특히 항생제의 부적절한 사용으로 전 세계적으로 항생제 내성 부담을 증가시키는 것입니다. 따라서 항생제의 전 세계 소비 및 사용은 항상 면밀히 모니터링됩니다. 이 리뷰는 UN의 17가지 지속 가능한 개발 목표(SDGs), 하나의 건강 접근법,” 인간, 동물 및 공유 환경 사이의 명확한 연결을 인정함으로써 최상의 건강 결과를 달성하기 위한 다학제적 노력을 통합하는 시스템입니다. 일반 청중의 대중 인식 및 건강 이해력의 중요성은 글로벌 및 지역 실행 계획의 일환으로 더욱 강조되어야 합니다. 항균제 내성은 계속해서 21세기의 주요 글로벌 공중 보건 딜레마입니다. 이미 이 주제는 G7 국가들로부터 상당한 정치적 의견을 받고 있으며 수많은 정치 회의의 의제에 계속 포함되고 있습니다. AMR을 적절하게 다루지 못한 결과는 심오하며, 출산, 수술 및 사지 개방 골절과 관련된 일상적인 감염이 잠재적으로 생명을 위협할 수 있는 항생제 이전 시대로의 회귀로 추정됩니다. AMR 자체는 사회 인류학, 시민 불안/전쟁, 디아스포라, 민족 이주, 정치 체제, 의료, 경제, 인구 및 개인 수준의 사회적 행동, 건강 지식, 지구 기후 사건, 글로벌 여행 및 제약 혁신을 포함한 요인의 축소판을 나타냅니다. 따라서 AMR을 적절하게 다루고 추가 AMR 출현을 막는 데 도움이 되는 솔루션을 찾는 것은 복잡합니다. 성공을 위해서는 현재와 미래에 인간과 동물의 건강을 유지할 수 있는 효과적인 항균제를 세계가 계속해서 충분히 보유할 수 있도록 개인, 지역 사회 및 국가 모두가 함께 노력해야 합니다. 인구 및 개인 수준의 사회적 행동, 건강 문해력, 지리학적 사건, 전 세계 여행 및 제약 혁신 및 투자

https://www.frontierspartnerships.org/files/Articles/11387/bjbs-80-11387-HTML-r1/image_m/bjbs-80-11387-g001.jpg

추천도서

항생제의 길잡이 | 4 판 | , 대한감염학회 저자(글) · 일러스트부 그림/만화, 군자출판사 · 2016년 04월 27

감염의 전장에서, 토머스 헤이거 저자(글) · 노승영 번역, 동아시아 · 2020년 05월 22일

슈퍼버그, 맷 매카시 저자(글) · 김미정 번역, 흐름출판 · 2020년 02월 24일

내성 전쟁, 무하마드 H. 자만 저자(글) · 박유진 번역, 7분의언덕 · 2021년 08월 20일

세상을 바꾼 전염병, 예병일 저자(글), 다른 · 2015년 06월 22일

세상을 바꾼 전염병의 역사, 클라라 프론탈리 저자(글) · 임희연 번역, 봄나무 · 2015년 06월 10일

https://simagebank.com/wp/599/

자연 선택과 진화-과학 심화 탐구

자연 선택과 생물의 진화

자연 선택

⑴ 표현형에 영향을 미치는 돌연변이가 발생하면 집단의 개체들 사이에 표현형 및 적응도의 차이가 생긴다.

⑵ 생존과 생식의 능력, 즉 적응도를 높이는 대립유전자의 빈도가 증가하는 과정이 자연 선택이다. 자연 선택은 해로운 돌연변이의 빈도가 증가하는 것을 막으며 이로운 돌연변이의 빈도를 높인다.

⑶ 지구 생물의 다양성은 궁극적으로 이로운 돌연변이의 발생과 이에 대한 자연 선택의 결과이다.

⑷ 자연 선택의 사례: DDT가 살포되기 전에는 모기 대부분은 DDT에 저항성이 없었다. DDT가 살포되는 환경에서 DDT 저항성 유전자를 가진 개체가 살아남아 더 많은 자손을 남기면서 DDT 저항성 유전자의 빈도가 점점 증가하였다. 즉, DDT가 살포되는 환경에서 살아남기 적합한 유전자가 자연 선택된 것이다.

진화의 증거와 진화의 원리

생물의 분류와 생물의 다양성

Understanding Natural Selection: Essential Concepts and Common Misconceptions

https://evolution-outreach.biomedcentral.com/articles/10.1007/s12052-009-0128-1

자연 선택 이해: 필수 개념과 일반적인 오해

자연 선택은 진화 변화의 핵심 메커니즘 중 하나이며 적응 기능의 진화를 담당하는 과정입니다. 자연 선택에 대한 실무 지식 없이는 생물이 어떻게, 왜 다양성과 복잡성을 나타내게 되었는지 이해하는 것이 불가능합니다. 자연 선택에 대한 이해는 의학, 농업, 자원 관리 등 실제적인 맥락에서도 점점 더 중요해지고 있습니다. 불행하게도 연구에 따르면 자연 선택은 일반적으로 중등 이후 생물학 교육을 받은 많은 개인 사이에서도 매우 잘 이해되지 않는 것으로 나타났습니다. 이 논문은 자연 선택의 기본 과정에 대한 개요를 제공하고, 이 과정에 대한 오해의 정도와 가능한 원인을 논의합니다.

https://media.springernature.com/full/springer-static/image/art%3A10.1007%2Fs12052-009-0128-1/MediaObjects/12052_2009_128_Fig1_HTML.gif?as=webp
https://media.springernature.com/full/springer-static/image/art%3A10.1007%2Fs12052-009-0128-1/MediaObjects/12052_2009_128_Fig2_HTML.gif?as=webp

Evolution Is Change in the Inherited Traits of a Population through Successive Generations

https://www.nature.com/scitable/knowledge/library/evolution-is-change-in-the-inherited-traits-15164254/

진화는 연속적인 세대를 통해 집단의 유전된 특성이 변화하는 것입니다

진화는 연속적인 세대를 통해 유기체 집단의 유전적 특성이 변화하는 것으로 정의됩니다. 살아있는 유기체가 번식할 때, 그들은 자손에게 일련의 형질을 물려줍니다. 이러한 특성은 나비 날개의 패턴이나 악어의 비늘 수와 같이 유형적이고 명백할 수 있지만, 유기체의 DNA를 구성하는 뉴클레오티드 염기 서열만큼 비교적 익명의 특성도 포함합니다. 사실, 우리가 진화적 유전에 관해 이야기할 때, 우리가 실제로 언급하고 있는 것은 후자입니다. 즉, 한 세대에서 다음 세대로 유전 서열이 전달되는 것입니다. 집단 내에서 특정 유전자 서열이 변하고(예: 돌연변이를 통해) 이러한 변화가 연속적인 세대에 걸쳐 유전되는 경우, 이것이 바로 진화의 문제입니다.

Does evolutionary theory need a rethink?

https://www.nature.com/articles/514161a

How does epigenetics influence the course of evolution?

https://royalsocietypublishing.org/doi/10.1098/rstb.2020.0111?url_ver=Z39.88-2003&rfr_id=ori%3Arid%3Acrossref.org&rfr_dat=cr_pub++0pubmed

후성유전학은 세포 분열을 통해 전달될 수 있지만, DNA 서열의 변화로 설명할 수 없는 유전자 활동의 변화에 ​​대한 연구입니다. 후생적 메커니즘은 유전자 조절, 표현형 가소성, 발달 및 게놈 무결성 보존의 핵심입니다. 후성유전적 메커니즘은 일반적으로 모든 세대에서 삭제되고 재설정되어 유전될 수 없으므로 진화적 변화에 미미한 이바지하는 것으로 간주하는 경우가 많습니다. 그런데도 후생적 변이가 진화 과정에 직간접적으로 이바지한다는 인식이 커지고 있습니다. 첫째, 일부 후성유전적 상태는 세대 간 전달되어 자손의 표현형에 영향을 미칩니다. 게다가 성실한 유전되는 ‘에피알레일’이 존재하며 식물에서 매우 흔합니다. 따라서 이러한 상피 대립유전자는 기존의 DNA 서열 기반 대립유전자와 같은 방식으로 자연 선택의 대상이 될 수 있습니다. 둘째, 후생적 변이는 표현형 가소성과 표현형 변이를 향상해 서열 기반 유전적 변이에 대한 자연 선택의 효과를 조절할 수 있습니다. 셋째, 표현형 가소성이 유기체의 적응성의 핵심이라는 점을 고려할 때, 가소성과 순응을 생성하는 후생유전학적 메커니즘은 진화론에서 고려하는 데 중요합니다. 넷째, 일부 유전자는 자신이 파생된 부모의 성별을 식별하는 ‘각인’을 선택하여 부모 의존 유전자 발현 및 효과를 유도합니다. 이러한 효과는 잡종 기능 장애를 일으키고 종분화에 이바지할 수 있습니다.

Evolutionary consequences of epigenetic inheritance

https://www.nature.com/articles/s41437-018-0113-y

후성유전의 진화적 결과

후생유전학과 진화

후성유전학적 효과는 일반적일 뿐만 아니라 진화의 여러 측면에 영향을 미치고 기초가 될 수 있습니다. 이는 단일 세대 내에서만 발현되는 후성유전적 영향과 세대 간 후성유전적 유전 모두에 해당합니다. 이번 특집호에서는 (Banta and Richards( 2018)) 후생유전학이 여러 진화적 측면에 깊은 영향을 미칠 수 있음을 보여줍니다. 표현형 변이의 분할을 위한 정량적 유전 공식을 사용함으로써 후생적 메커니즘이 모든 매개변수의 기초가 되거나 영향을 미칠 수 있음을 보여줍니다. 더욱이, 그러한 후생적 조절이 유전된다면, 유전적 변이로 잘못 해석될 수 있습니다. 따라서 자연 개체군에 후성유전학적 표지가 널리 존재한다는 것은 정량적 유전 매개변수를 추론하거나 정량적 특성의 개체군 차이를 추정하려는 연구자들에게 어려운 과제입니다. 표현형 가소성은 유전적 유사성에 기초하지 않은 개인들 사이의 유사성을 유발할 수 있다는 것이 잘 알려졌지만(Pujol et al. 2008), 특성의 후성 유전에 대해서도 마찬가지입니다. 저자들은 전체 유전적 변이로부터 후생적 변이를 분리하는 것을 목표로 하는 육종 설계 및 분석의 개발을 검토하고 후성적 조절이 여전히 나머지 정량적 유전 매개변수에 영향을 미칠 수 있음을 강조합니다.

Evidence Supporting Biological Evolution

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK230201/

생물학적 진화를 뒷받침하는 증거

길을 따라가면 적어도 35억 년 전에 존재했던 원시 ‘생명’의 기원부터 오늘날 존재하는 생명의 풍부함과 다양성까지 이어집니다. 이 경로는 진화의 산물로 가장 잘 이해됩니다.

대중적인 견해와는 달리, 생물학적 진화라는 용어나 개념은 찰스 다윈과 그의 주요 저서인 자연 선택에 의한 종의 기원( On the Origin of Species by Means of Natural Selection, 1859)에서 시작되었습니다. 고대 그리스 철학자들을 비롯한 많은 학자는 유사한 종이 공통 조상으로부터 유래했다고 추론했습니다. “진화(evolution)”라는 단어는 1647년에 비생물학적 연결로 영어에 처음 등장했으며, 단순한 시작부터 모든 종류의 진행을 의미하는 영어로 널리 사용되었습니다. 다윈이 생물학적 진화를 언급하기 위해 가장 자주 사용한 용어는 “변형을 통한 혈통”이었는데, 이는 오늘날에도 그 과정에 대한 좋은 간략한 정의로 남아 있습니다.

다윈은 진화가 자연적으로 발생한 변이에 따른 유기체의 차등적 생존으로 설명될 수 있다고 제안했는데, 그는 이 과정을 “자연 선택”이라고 불렀습니다. 이 견해에 따르면 유기체의 자손은 유전되는 방식으로 서로 다르며 부모와도 다릅니다. 즉, 유기체의 차이를 유전적으로 자신의 자손에게 물려줄 수 있습니다. 더욱이, 자연의 유기체는 일반적으로 식량, 공간 및 기타 환경 자원의 제약을 고려할 때 생존하고 번식할 수 있는 것보다 더 많은 자손을 생산합니다. 특정 자손이 특정 환경에서 이점을 제공하는 특성이 있다면 해당 유기체는 생존하여 이러한 특성을 물려줄 가능성이 더 큽니다. 세대를 거듭하면서 차이가 축적되면서 유기체의 개체군은 조상으로부터 갈라집니다.

Towards evolutionary predictions: Current promises and challenges

https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/eva.13513

진화론적 예측을 향하여: 현재의 약속과 과제

진화는 전통적으로 역사적이고 기술적인 과학이었으며, 미래의 진화 과정을 예측하는 것은 오랫동안 불가능하다고 여겨져 왔습니다. 그러나 진화예측은 의학, 농업, 생명공학, 보존 생물학 분야에서 점점 더 개발되고 사용되고 있습니다. 진화 예측은 미래를 준비하거나, 진화 과정을 바꾸거나, 진화 과정을 얼마나 잘 이해하는지 확인하는 등 다양한 목적으로 사용될 수 있습니다. 마찬가지로, 우리가 예측하려는 진화된 인구의 정확한 측면도 다를 수 있습니다. 예를 들어, 어떤 유전자형이 지배적인지, 개체군의 적합성 또는 개체군의 멸종 확률을 예측하려고 할 수 있습니다. 게다가, 항상 그렇게 인식되지는 않는 진화론적 예측의 용도가 많이 있습니다. 이 검토의 주요 목표는 진화예측이 이루어지는 상황의 폭을 보여줌으로써 다양한 연구 분야의 방법과 데이터에 대한 인식을 높이는 것입니다. 우리는 다양한 진화예측이 예측 범위, 시간 규모 및 정밀도로 설명되는 공통 구조를 공유하는 방법을 설명합니다. 그런 다음 SARS-CoV2 및 인플루엔자부터 CRISPR 기반 유전자 드라이브 및 생명공학의 지속 가능한 제품 형성에 이르기까지 다양한 사례를 사용하여 진화를 예측하는 방법, 예측 가능성에 영향을 미치는 요인 및 바람직하지 않은 방향으로의 진화를 방지하기 위해 예측을 사용할 수 있는 방법에 대해 논의합니다. 또는 유익한 진화(즉, 진화 제어)를 촉진합니다. 우리는 이 검토가 진화예측을 위한 공통 언어를 확립함으로써 분야 간의 협력을 촉진할 수 있기를 바랍니다.

Increasing our ability to predict contemporary evolution

https://www.nature.com/articles/s41467-020-19437-x

환경 변화로 인해 종들이 적응하거나 멸종 위기에 처하게 되면서 과학자들이 진화를 어느 정도까지 예측할 수 있는지에 관한 고전적인 논쟁이 새로운 긴급성을 갖게 되었습니다. 우리는 결정론적 자연 선택에 대한 이해 부족을 초래하는 데이터 제한으로 인해 진화를 예측하는 능력이 어떻게 제한될 수 있는지 강조합니다. 그런 다음 접근 방식의 조합을 포함하는 실행 가능한 경험적 노력을 통해 이러한 데이터 제한을 어떻게 줄일 수 있는지 강조합니다.

https://media.springernature.com/full/springer-static/image/art%3A10.1038%2Fs41467-020-19437-x/MediaObjects/41467_2020_19437_Fig3_HTML.png?as=webp

추천도서

생명의 진화, 처음 읽는 진화 입문서, 박상윤 저자(글), 전파과학사 · 2023년 07월 11일

인류의 진화, 아프리카에서 한반도까지 우리가 우리가 되어온 여정, 이상희 저자(글), 동아시아 · 2023년 06월 19일

매일 매일의 진화 생물학, 롭 브룩스 저자(글) · 최재천 , 한창석 번역, 바다출판사 · 2022년 12월 20일

진화와 의학, 로버트 펄먼 저자(글) · 김홍표 번역, 지식을만드는지식 · 2015년 04월 20일

공생 멸종 진화, 생명 탄생의 24가지 결정적 장면, 이정모 저자(글), 나무나무 · 2015년 09월 11일

뼈, 그리고 척추동물의 진화, 매슈 F. 보넌 저자(글) · 황미영 번역 · 박진영 감수, 뿌리와이파리 · 2018년 11월 28일

진화, 모든 것을 설명하는 생명의 언어, 칼 짐머 저자(글) · 이창희 번역, 웅진지식하우스 · 2018년 09월 14일

미토콘드리아, 박테리아에서 인간으로, 진화의 숨은 지배자, 닉 레인 저자(글) · 김정은 번역, 뿌리와이파리 · 2009년 01월 23일

형태의 기원, 자연 그리고 인간이 만든 모양의 탄생과 진화, 크리스토퍼 윌리엄스 저자(글) · 고현석 번역, 이데아 · 2023년 04월 10일

진화학 4 판, Strickberger 저자(글) · 김창배 , 김기중 , 김삼규 , 김상희 , 김원 , 김희수 , 류시현 , 민기식 , 민미숙 , 부성민 , 서영배 , 양은찬 , 용태순 , 이항 , 장천영 , 조수원 , 최세웅 , 한호현 , 황의욱 번역, 월드사이언스 · 2014년 08월 25일

https://simagebank.com/wp/599/

염기 서열 분석 차세대 염기 서열 분석 염기 서열 정보의 활용-과학 심화 탐구

The sequence of sequencers: The history of sequencing DNA

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4727787/

서열 분석기의 서열: DNA 서열 분석의 역사

생물학적 시료에서 핵산 잔기의 순서를 결정하는 것은 다양한 연구 응용 분야에서 필수적인 구성 요소입니다. 지난 50년 동안 수많은 연구자가 이러한 위업을 촉진하기 위한 DNA 및 RNA 분자 서열 분석 기술의 생산에 전념해 왔습니다. 이 시간 규모는 짧은 올리고뉴클레오티드의 서열 분석에서 수백만 개의 염기 서열 분석으로, 단일 유전자의 코딩 서열 추론을 향한 고군분투에서 신속하고 널리 이용 가능한 전체 게놈 서열 분석으로 이동하는 엄청난 변화를 목격했습니다. 이 기사에서는 여러 세대의 시퀀싱 기술을 반복하면서 그 기간을 훑어보며 그 과정에서 발견된 몇 가지 주요 발견, 연구자 및 시퀀스를 강조합니다.

1세대 방법을 통해 클론 DNA 집단의 서열 분석이 가능해졌습니다.

2세대는 많은 반응을 병렬화하여 처리량을 대폭 늘렸습니다.

3세대 방법을 사용하면 단일 DNA 분자의 직접적인 서열 분석이 가능합니다.

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4727787/bin/gr1.jpg
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4727787/bin/gr2.jpg
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4727787/bin/gr3.jpg

생물학 연구에서 DNA 서열 분석의 중요성은 아무리 강조해도 지나치지 않습니다. 가장 근본적인 수준에서는 육상 생명체를 정의하고 서로 구별할 수 있는 주요 특성 중 하나를 측정하는 방법입니다. 따라서 지난 반세기 동안 전 세계의 많은 연구자는 DNA 서열 분석을 뒷받침하는 기술을 개발하고 개선하는 데 많은 시간과 자원을 투자했습니다. 주로 접근 가능한 RNA 표적을 대상으로 작업하는 이 분야가 탄생할 당시 연구자들은 12개에서 100개까지의 뉴클레오타이드 길이에 해당하는 서열을 생성하는 데 수년을 힘들게 보냈습니다. 수년에 걸쳐 시퀀싱 프로토콜, 분자생물학 및 자동화의 혁신으로 시퀀싱 기술 역량이 향상되면서 비용은 절감되었습니다. 수백 개의 염기쌍 길이의 DNA를 읽을 수 있으며 대규모 병렬화를 통해 한 번의 실행으로 기가 베이스의 데이터를 생성할 수 있습니다. 연구원들은 젤을 붓는 것부터 코드를 실행하는 것까지 실험실에서 컴퓨터로 이동했습니다. 게놈이 해독되고, 논문이 출판되고, DNA 서열 데이터 저장소가 계속 늘어나면서 회사가 시작되었다가 나중에 해체되기도 했습니다. 따라서 여러 측면에서 상대적으로 최근의 미래 지향적인 연구 분야인 DNA 서열 분석은 풍부한 역사가 있습니다. 이 역사를 이해하면 현재 방법론에 대한 이해를 제공하고 이전 세대에서 배운 교훈이 다음 세대의 진행 상황에 영향을 미치므로 미래 방법론에 대한 새로운 통찰력을 제공할 수 있습니다.

DNA sequencing: an overview of solid-state and biological nanopore-based methods

https://link.springer.com/article/10.1007/s12551-021-00857-y

DNA 서열 분석: 고체 및 생물학적 나노기공 기반 방법의 개요

시퀀싱 분야는 출현 이후 상당한 관심을 끄는 주제이며 시간이 지남에 따라 점점 더 중요해지고 있습니다. 이 분야, 특히 DNA 및 RNA 서열 분석과 관련하여 인상적인 성과를 거두었습니다. 1950년대 Sanger와 동료들의 첫 번째 업적 이후 많은 시퀀싱 기술이 개발되었지만, 나머지 기술은 사라졌습니다. DNA 서열 분석은 3세대에 걸쳐 주요한 진화를 거쳤습니다. 세대마다 간략하게 언급되는 고유한 사양이 있습니다. 이들 세대 중에서 나노포어 시퀀싱은 여기에서 더 많은 관심을 받는 고유한 흥미로운 특성이 있습니다. 3세대 기술에 사용되는 선구적인 기술 중에서 생물학적 또는 고체 상태의 나노기공은 실험적으로 또는 이론적으로 광범위하게 연구되었습니다. 모든 시퀀싱 기술에는 장단점이 있으므로 나노포어도 이러한 일반 규칙에서 벗어나지 않습니다. 그 장애를 극복하기 위해 어떤 연구가 진행되었는지도 전반적으로 지적된다. 이 리뷰에서는 생물학적 및 고체 나노기공에 대해 자세히 설명하고 이들의 응용에 대해서도 간략하게 논의합니다.

https://media.springernature.com/lw685/springer-static/image/art%3A10.1007%2Fs12551-021-00857-y/MediaObjects/12551_2021_857_Fig2_HTML.png?as=webp
https://media.springernature.com/lw685/springer-static/image/art%3A10.1007%2Fs12551-021-00857-y/MediaObjects/12551_2021_857_Fig4_HTML.png?as=webp

1세대 방법은 혁신적이었지만 비용이 많이 들고 작은 가닥만 서열 분석할 수 있다는 단점이 있었습니다. 2세대 기술은 합리적인 시간 비용 규모로 게놈 서열 분석을 수정하고 처리량을 향상하는 동시에 오류가 발생할 수 있는 DNA 증폭이 여전히 필요했습니다. 3세대는 몇 단계 더 발전하여 직접 시퀀싱, 더 긴 염기 읽기, 실시간 시퀀싱 및 단일 분자 특성과 같은 특성을 획득했습니다. 새로운 기술을 기반으로 한 DNA 염기 서열 분석의 미래에 대해 매우 낙관적이어야 하지만, 여전히 연구자들이 극복해야 할 장애물이 있습니다. 더 진보적으로 보이는 것은 더 기밀이지만 훨씬 더 많은 계산 비용이 필요하므로 더 번거로운 양자 시뮬레이션입니다.

Sanger 염기서열분석 단계 및 기법

https://www.sigmaaldrich.com/KR/ko/technical-documents/protocol/genomics/sequencing/sanger-sequencing

Differences Between NGS and Sanger Sequencing

https://www.illumina.com/science/technology/next-generation-sequencing/ngs-vs-sanger-sequencing.html

Guidelines for Sanger sequencing and molecular assay monitoring

https://journals.sagepub.com/doi/10.1177/1040638720905833

Sanger 시퀀싱 및 분자 분석 모니터링에 대한 지침

Sanger 기술을 사용한 유전자 서열 분석, 즉 DNA 서열 분석은 수의학 진단 커뮤니티에서 널리 사용되었습니다. 본 기술은 PCR 결과를 검증하는 역할을 하며, 계통발생학적 분석, 역학조사, 법의학 조사에 필요한 유전자 서열 데이터를 제공하는 데 사용됩니다. 미국 수의학 실험실 진단사 협회의 실험실 기술 위원회는 검체 준비, 시퀀싱 시설 또는 기기 제출, 수행된 핵산 서열 데이터의 품질 평가, 진단 적용을 위한 기본 시퀀싱 데이터 및 계통발생 분석 생성을 위한 지침을 준비했습니다. 이 지침은 실험실이 일관되고 고품질의 제품을 제공하도록 지원하는 것을 목표로 합니다.

https://journals.sagepub.com/cms/10.1177/1040638720905833/asset/images/large/10.1177_1040638720905833-fig1.jpeg

Applications of Single-Cell DNA Sequencing

https://www.annualreviews.org/doi/10.1146/annurev-genom-111320-090436

지난 10년 동안 생명의 기본 단위인 단일 세포에 대한 게놈 분석이 가능해졌습니다. 단일 세포 DNA 시퀀싱은 체세포 돌연변이 유발, 유기체 발달, 게놈 기능 및 미생물학을 비롯한 다양한 연구 분야에서 이전에는 접근할 수 없었던 생물학적 질문에 대한 빛을 밝혀주었습니다. 단일 세포 DNA 시퀀싱은 또한 종양학, 생식능력 및 그 이상을 포괄하는 미래의 생의학 및 임상적 영향력을 약속합니다. RNA와 단백질을 프로파일링하는 단일 세포 접근 방식은 세포 다양성에 대한 이해를 크게 확장했지만, 생물학 및 중요한 생물 의학 응용 분야의 많은 근본적인 질문에는 단일 세포의 DNA 분석이 필요합니다. 여기에서는 단일 세포 DNA 염기 서열 분석이 고유하게 적합하거나 필요한 응용 분야와 생물학적 질문을 검토합니다.

https://www.annualreviews.org/na101/home/literatum/publisher/ar/journals/content/genom/2021/genom.2021.22.issue-1/annurev-genom-111320-090436/20210810/images/medium/gg220171.f1.gif

Next-Generation Sequencing Technology: Current Trends and Advancements

https://www.mdpi.com/2079-7737/12/7/997

차세대 시퀀싱 기술: 현재 동향 및 발전

차세대 시퀀싱(NGS)은 유전체학 연구에 사용되는 강력한 도구입니다. NGS는 한 번에 수백만 개의 DNA 단편의 서열을 분석하여 게놈 구조, 유전적 변이, 유전자 활동 및 유전자 행동 변화에 대한 자세한 정보를 제공할 수 있습니다. 최근의 발전은 더 빠르고 정확한 시퀀싱, 비용 절감 및 향상된 데이터 분석에 중점을 두었습니다. 이러한 발전은 유전체학에 대한 새로운 통찰력을 제공하고 질병 및 맞춤형 의료에 대한 이해를 향상하는 데 큰 가능성을 제시합니다. 이 리뷰 기사에서는 NGS 기술에 대한 개요와 NGS 기술이 임상 유전체학, 암, 전염병, 미생물 군집 연구 등 다양한 연구 분야에 미치는 영향을 제공합니다.

https://www.mdpi.com/biology/biology-12-00997/article_deploy/html/images/biology-12-00997-g002.png
https://www.mdpi.com/biology/biology-12-00997/article_deploy/html/images/biology-12-00997-g003-550.jpg

A Review on the Applications of Next Generation Sequencing Technologies as Applied to Food-Related Microbiome Studies

https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fmicb.2017.01829/full

식품 관련 미생물 연구에 적용되는 차세대 염기 서열 분석 기술의 응용에 대한 검토

차세대 염기 서열 분석(NGS) 기술의 발전으로 연구자들은 미생물의 세계를 더 넓고 깊은 관점에서 연구하고 이해할 수 있게 되었습니다. DNA 염기 서열 분석 기술의 현대적 진보는 박테리아 게놈의 더욱 정밀한 특성 규명을 가능하게 했을 뿐만 아니라, 게놈 본질이 환경이 특정 신체 생태인지 아닌지에 관계없이 환경에 서식하는 미생물의 결합된 유전 물질인 복잡한 미생물군집의 더 깊은 분류학적 식별을 제공했습니다. (예: 인간 장 내용물) 또는 식품 제조 시설 에코니쉬(예: 바닥 배수구). 현재까지 16S rDNA 시퀀싱, 메타유전체학 및 메타전사체학은 식품 관련 미생물군집의 분류학적 식별 및 특성화에 사용되는 세 가지 기본 시퀀싱 전략입니다. 이러한 시퀀싱 전략은 DNA 및 RNA 서열 식별을 위해 다양한 NGS 플랫폼을 사용했습니다. 전통적으로 16S rDNA 염기서열 분석은 식품 관련 미생물군집의 분류학적 구성을 이해하는 데 핵심적인 역할을 해왔습니다. 최근 메타게놈 접근법은 종 수준/균주 수준 특성화를 제공함으로써 미생물군집에 대한 이해를 향상시켰습니다. 또한, 메타전사체 접근법은 단일 미생물군집 내에서 서로 다른 미생물 군집 간의 복잡한 상호작용의 기능적 특성화에 기여했습니다. 많은 연구에서 발효 식품의 미생물군집 조사에 NGS 기술을 사용하는 것이 강조되었습니다. 그러나 비발효 식품의 미생물 연구에 NGS 기술을 활용하는 것은 제한적입니다.

The road ahead in genetics and genomics

https://www.nature.com/articles/s41576-020-0272-6#Sec12

유전학과 유전체학의 미래

Nature Reviews Genetics 20주년을 기념하여 우리는 12명의 주요 연구자에게 유전학과 유전체학 분야가 직면한 주요 과제와 기회에 대해 생각해 보도록 요청했습니다. 특정 연구 분야를 염두에 두고 그들은 현재의 활동 상태를 조사하고 궁극적으로 모든 사람이 유전 및 게놈 연구의 이점을 느낄 수 있도록 향후 몇 년 동안 수행해야 할 작업을 강조합니다.

Utility and Diversity: Challenges for Genomic Medicine

https://www.annualreviews.org/doi/10.1146/annurev-genom-120220-082640

유용성과 다양성: 게놈 의학의 과제

게놈 정보는 침투성이 높은 유전적 조건을 넘어 침투성이 낮은 유전형과 일반적인 장애까지 확장되어 임상 치료에서 점점 더 많은 역할을 할 준비가 되어 있습니다. 그러나 이러한 변화로 인해 임상적 유용성에 대한 문제가 중요한 과제가 되었습니다. 게놈 정보의 다양한 용도를 평가하고 해당 정보를 획득하는 데 필요한 정보를 결정하려면 공동 노력이 필요합니다. 해당 프로세스가 공평한 이익을 제공하려면 또 다른 과제도 해결해야 합니다. 바로 게놈 데이터의 다양성 부족입니다. 현재의 게놈 지식은 주로 유럽계 인구로부터 나오므로, 게놈학의 건강상의 이점이 나타날 때 대부분 인구가 부족해질 위험이 있습니다. 이 두 가지 과제는 유전학자로서의 내 경력을 정의했으며 해결책은 학문적, 사회적 격차를 뛰어넘는 대화에서 시작되어야 한다는 점을 가르쳐 주었습니다.

추천도서

유전학의 이해 6 판, Benjamin A. Pierce 저자(글) · 전상학 , 권혁빈 , 김남수 , 김세재, 남종길, 소문수, 심용희, 오범석, 유시욱, 이일하, 이임순, 이준규, 장연규, 정민걸 외 번역, 라이프사이언스 · 2017년 09월 01일

후성유전학, 후성유전학연구회 저자(글), 범문에듀케이션 · 2022년 09월 01일

HARTWELL 유전학, Leland H. Hartwell , Michael L. Goldberg , Janice A. Fischer , Leroy Hood 저자(글) · 한국유전학회 번역, 교문사 · 2022년 01월 28일

의학유전학, 8 판, 박선화 외 저자(글), 범문에듀케이션 · 2017년 09월 01일

유전공학의 이해, 남상욱 , 권혁빈 , 최선심 저자(글), 라이프사이언스 · 2016년 09월 01일

GENOMES 4 유전체 분자 생물학, T.A. BROWN 저자(글) · 이동희 , 하영미 , 권혁빈 , 정인실 번역, 월드사이언스 · 2018년 08월 20일

식물유전자, 유전체 그리고 유전학, Erich Grotewold , Joseph Chappell , Elizabeth A. Kellogg 저자(글) · 김남수 , 양태진 , 박용진 번역, 월드사이언스 · 2017년 02월 20일

유전체 데이터 분석 1 기초편, 김주한 , 이계화 , 김태민 , 김도균 , 김동섭 , 한미령 , 최선심 , 이채영 , 최무림 , 강양제 , 이영희 , 노미나 저자(글), 범문에듀케이션 · 2023년 04월 03일

유전체 데이터 분석 2: NGS편, 암과 질병 유전체, 김주한 저자(글), 범문에듀케이션 · 2020년 03월 02일

유전체 전망대에서 바라본 필수 유전학, Daniel L. Hartl 저자(글) · 김성룡 , 김남우 , 김선형 , 김욱 , 김현희 , 배영석 , 소문수 , 유민 , 이동현 , 이정섭 , 이준규 , 이형호 , 전성호 , 최인순 , 최철용 , 황승용 번역, 월드사이언스 · 2020년 10월 15일

식물생명공학, 김선형 , 강시용 , 곽유리나 , 권석윤 , 김승일 , 김종보 , 반충진 , 우수영 , 이효연 저자(글), 라이프사이언스 · 2023년 03월 01일

인류의 미래를 바꿀 유전자 이야기, 김경철 저자(글), 세종서적 · 2020년 04월 27일

유전자 임팩트, 케빈 데이비스 저자(글) · 제효영 번역 · 배상수 감수, 브론스테인 · 2021년 05월 26일

DNA 혁명 크리스퍼 유전자가위, 전방욱 저자(글), 이상북스 · 2017년 11월 07일

https://simagebank.com/wp/599/

효소의 활용-과학 심화 탐구

효소의 활용, 생명공학적 응용, 효소 치료, 효소 고정화 기술, 산업 응용,

▣ 생명체 내에서의 화학 반응

(1) 생명체에서 일어나는 대부분의 화학 반응에는 효소의 촉매 반응이 필요하다.

(2) 촉매: 화학 반응에서 소모되거나 변화되지 않으면서 활성화 에너지를 변화시켜 반응 속도를 조절하는 물질이다. 생명체 밖에서 화학 반응을 촉진하는 무기 화합물은 무기 촉매라고 부른다.

(3) 생명체에서 합성되는 효소는 생체 촉매라고 부르며, 생명체에서 화학 반응의 속도를 증가시킨다.

▣ 효소의 작용

(1) 활성화 에너지는 화학 반응이 일어나는 데 필요한 최소한의 에너지로, 반응물이 넘어야 할 에너지 장벽이다.

(2) 반응물이 활성화 에너지 이상의 충분한 에너지를 가지고 있어야만 화학 반응이 일어날 수 있다.

(3) 효소는 활성화 에너지를 낮춤으로써 더 많은 반응물이 화학 반응에 참여할 수 있도록 하여 화학 반응의 속도를 증가시킨다.

(4) 반응열: 화학 반응이 일어날 때 방출되거나 흡수되는 열로 반응물과 생성물의 에너지 차이를 의미한다. 반응열은 효소의 영향을 받지 않기 때문에 효소의 유무에 상관없이 반응열의 크기는 일정하다.

(5) 효소와 결합하는 반응물을 기질이라고 하며, 효소는 기질과 결합하여 효소·기질 복합체를 형성함으로써 활성화 에너지를 낮추어 화학 반응을 촉진한다.

(6) 기질이 효소의 활성 부위에 결합하여 복합체를 이루고 있는 동안 효소의 촉매 작용으로 기질은 생성물로 전환되며, 화학 반응이 끝나면 효소와 생성물이 분리된다. 분리된 효소를 다시 새로운 기질과 결합하여 촉매 작용을 반복한다.

(7) 효소는 화학 반응 동안 소모되거나 변화하지 않으면서 기질과 결합하여 촉매 작용을 반복하기 때문에 생명체에서 효소가 촉매하는 화학 반응은 매우 빠르게 일어난다.

Use of Enzymes in Dairy Industry: A Review of Current Progress

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC8410156/

유제품 산업에서의 효소 활용: 현재 진행 상황 검토

이 리뷰 논문은 유제품 응용 분야에서 다양한 효소의 기능과 사용에 대한 귀중한 정보를 제공하는 것을 목표로 했습니다. 효소는 단백질이라고 불리며 특정 반응을 촉매합니다. 모든 효소는 특정한 결과를 가져오는 특정한 반응을 시작하도록 고안되었습니다. 또한, 인체에는 수많은 효소가 존재합니다. 유제품 응용에는 소유제품의 알레르기 특성을 줄이기 위한 프로테아제와 치즈의 풍미를 향상하기 위한 리파아제와 같은 다양한 효소의 사용이 포함됩니다. 산에 용해되는 카세인은 향이 없고 단백질 분해의 한계로 인해 음료 및 산성 식품에 첨가하기에 적합할 수 있습니다. 카세인 가수분해물은 소 우유에 알레르기가 있는 신생아를 위한 우유 단백질 기반 식품에 사용하는 것이 더 좋습니다. 지방분해는 스위스 치즈의 맛에 중요한 역할을 합니다. 블루 치즈의 후추 맛은 단쇄 불포화 지방과 메틸 케톤에 의해 생성됩니다. 유제품 공정에 제한적으로 적용되는 많은 보조 효소로는 설프하이드릴 산화효소, 락토페록시다제, 포도당 산화효소, 카탈라제, 라이소자임 및 슈퍼옥사이드 디스뮤타제가 있습니다. 카탈라아제와 포도당 산화효소는 모두 식품 보존 과정에 활용됩니다. 유제품의 더 나은 생산과 유제품 기술의 미래를 위해 필요한 유제품의 미량 효소 범위. 유제품 가공에 사용되는 미생물 효소 생산을 위한 세계 시장은 눈에 띄게 증가하고 있습니다. 그러나 시장에는 제한된 수의 효소 생산 산업이 있습니다. 단백질분해효소, 락타아제, 리파아제의 생산, 미생물 레넷은 실험실과 소규모에서 증가하고 있습니다. 가까운 장래에, 영양실조와 비만을 극복하고 저지방 및 건강식품으로 전환하기 위해 국가에서 상당한 영양 가치가 있는 유제품에 대한 요구로 인해 이러한 효소에 대한 필요성은 의심할 여지 없이 많이 증가할 것입니다.

키워드: 유제품 산업, 효소, 유제품, 유제품 기술

효소원천응용
아밀라아제바실러스 (Bacillus) 및 아스퍼질러스 (Aspergillus) 종 .전분 액화 . 베이킹 , 양조 , 섬유 , 세제 등
베타 -글루카나제바실러스 종 .양조 및 동물 사료
브로멜라인파인애플고기연화 , 맥주의 냉각
셀룰라아제트리코데르마종 (Trichoderma spp.)섬유 바이오연마 , 펄프 및 종이 , 세제
키모신종아리 위치즈 제조
피신무화과고기 연화
포도당바실러스 (Bacillus) 및 스트렙토마이세스 (Streptomyces) 종 .포도당을 과당으로 이성질체화
리파제슈도모나스 종 .세제 , 유지 , 베이킹 , 가죽 , 종이 등
파파인파파야 라텍스고기 연화 , 양조
펙티나제아스퍼질러스종과일 주스 정화의 펙틴 가수분해
프로테아제바실러스 (Bacillus) 및 아스퍼질러스 (Aspergillus) 종 .세제 , 양조 , 고기 연화 , 베이킹 , 세척 , 동물성 단백질 가수분해 , 기능성 고기 단백질 등
펩신도살된 동물의 위소화 보조제
트랜스글루타미나제스트렙토미세스 종 .단백질 가교 및 겔화 및 고기 결합
트립신도살된 동물의 위소화 보조제 .

Current Technological Improvements in Enzymes toward Their Biotechnological Applications

https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fmicb.2016.00965/full

생명공학적 응용을 위한 효소의 현재 기술 개선

극한성 물질의 효소는 고유한 특성과 극한 조건에서 엄청난 촉매 작용 능력으로 인해 연구자들 사이에서 관심을 불러일으키고 있습니다. 커뮤니티의 요구가 더욱 강화됨에 따라 연구자들은 다양한 접근 방식을 적용하고 있습니다. 호극성 종의 데이터베이스를 늘리기 위한 메타유전체학. 더욱이, 재조합 DNA 기술과 단백질 공학의 다양한 도구를 활용하여 자연 발생 효소에 대한 혁신이 이루어지고 있으며, 이를 통해 공정에 더 잘 맞도록 효소를 재설계할 수 있습니다. 이 리뷰에서 우리는 낮은 온도에서 생존하는 동안 호냉성균의 생화학적 제약에 대해 논의합니다. 우리는 그러한 효소의 출처와 시험관 내에서의 현재 지식을 요약합니다. 생명공학적 잠재력을 탐구하기 위해 돌연변이 유발을 통한 변형. 마지막으로, 비용 효율적인 방식으로 공정의 효율성을 높이기 위해 미생물 세포 표면 디스플레이를 요약합니다.

https://www.frontiersin.org/files/Articles/206451/fmicb-07-00965-HTML/image_m/fmicb-07-00965-g003.jpg
https://www.frontiersin.org/files/Articles/206451/fmicb-07-00965-HTML/image_m/fmicb-07-00965-t002.jpg
https://www.frontiersin.org/files/Articles/206451/fmicb-07-00965-HTML/image_m/fmicb-07-00965-g006.jpg

표적 효소 또는 단백질을 코딩하는 새로운 유전자의 채굴

새로운 효소를 복구하기 위해 배양 독립적인 접근 방식인 메타게놈학은 현대 생명공학에 축복이 되었습니다. Metagenomics는 환경 샘플에서 직접 게놈 DNA를 분리하는 것으로 구성되며, 이는 높은 처리량 시퀀싱 즉, 분석됩니다. 배양 중 중요한 개체의 손실을 최소화하는 샷건 시퀀싱, 454 파이로시퀀싱. Metagenomics 접근법은 미생물 군집의 구조와 기능적 잠재력을 분석하는 데 사용됩니다. 유전자/종 풍부함, 분포 등의 구조적 분석은 종종 서열 기반 스크리닝으로 수행되는 반면, 환경 미생물 군집의 기능적 잠재력은 기능 기반 스크리닝을 통해 평가됩니다. 메타유전체학은 배양이 거의 불가능하고 산업적 가치가 있는 새로운 효소를 제공하는 극한균에 대한 관문을 열었습니다.

Enzyme Therapy: Current Challenges and Future Perspectives

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC8431097/

효소 치료: 현재의 과제와 미래의 전망

최근 몇 년 동안 효소는 섬유증 상태, 안구 병리 또는 관절 문제와 같은 대사 결핍부터 암 또는 심혈관 질환에 이르기까지 다양한 병리학에 대한 유망한 치료 도구로 떠 오르고 있습니다. 효소의 촉매 활성을 기반으로 한 치료법은 광범위한 표적 분자를 전환하여 올바른 생리학적 대사를 회복시킬 수 있습니다. 이러한 치료법은 친화력과 특이성으로 인해 확립된 치료법에 비해 몇 가지 장점이 있습니다. 그러나 효소는 짧은 생체 내 반감기, 표적 작용의 결여, 특히 효소에 대한 환자의 면역 체계 반응과 같은 몇 가지 문제를 제시합니다. 이러한 이유로 치료 중 혈청 면역 반응을 감시하는 것이 중요합니다. 이는 기존 기술(ELISA)뿐만 아니라 마이크로어레이와 같은 새로운 유망 도구를 통해서도 달성할 수 있습니다. 이러한 분석은 높은 처리량의 분석 능력, 단순성 및 효소 치료 중 환자의 면역 반응을 감시할 수 있는 잠재력으로 인해 인기를 얻었습니다. 성장하고 있는 이 분야에서는 코로나 19와 같은 현재의 건강 문제를 해결하기 위한 연구가 여전히 진행 중입니다. 현재 안지오텐신 전환 효소 2(ACE2)를 사용하는 유망한 치료 대안이 코로나19 치료를 위해 연구되고 있습니다.

키워드: 생명공학, 효소 치료, 캡슐화, 효소의 분자 변형, 면역 반응 모니터링, 마이크로어레이, 코로나19

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC8431097/bin/ijms-22-09181-g001.jpg
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC8431097/bin/ijms-22-09181-g002.jpg
질병 /
상태
원인 /병리치료 효소 *참조 .
리소좀축적질환
고셔병글루코세레브로시다제 결핍글루코세레브로시다아제 [Cerezyme, Vprip, Taliglucerase alpha][ 25 ], (a,b,c)
헌터증후군이두로네이트 -2-설파타제 결핍이두로네이트 -2-설파타제 [Elaprase][ 26 ], (d)
파브리병α-갈락토시다아제 A 결핍α, β-갈락토시다아제 A [Replagal, Fabrazyme][ 28 ], (e,f)
헐러증후군α-L-이두로니다제 결핍α-L-이두로니다제 [알두라자임 ][ 29 ], (g)
모르퀴오 증후군 A 형N-아세틸갈락토사민 -6-설페이트 설파타제 결핍N-아세틸갈락토사민 -6-설페이트 설파타제
[비미짐 ]
[ 30 ], (h)
마로토 -라미
증후군
아릴설파타제 B 결핍N-아세틸갈락토사민 -4-설파타제 [나글라자임 ][ 31 ], (i)
교활한 증후군β-글루쿠로니다제 결핍β-글루쿠로니다아제 [Mepsevii][ 32 ], (j)
α-만노신증α-D-만노시다제 결핍벨마나제 α [람제데 ][ 33 ], (k)
바텐병트리펩 티딜 펩티다제 1 의 결핍세리포나제 α [브리네우라 ][ 34 ], (l)
폼페병산성 α-글루코시다제 결핍α-글루코시다제 [미오자임 ][ 35 ], (m)
대사 결핍
외분비 췌장 부전 (EPI)췌장 효소 의 분비 부족췌장효소 [엔제피 ][ 36 , 37 , 38 ], (n)
페닐케톤뇨증 (PKU)페닐알라닌 수산화효소 (PAH) 결핍PAH 및 페닐알라닌 암모니아 분해효소 PAH [Palynziq][ 39 ], (o)
중증복합면역결핍증 (SCID)아데노신 탈아미노 효소 (ADA) 결핍폴리에틸렌글리콜 공액 ADA[ 40 , 41 ]
월만병리소좀산 리파제 결핍리소좀산 리파제 [카누마 ][ 42 ], (p)
급성 간헐 포르피린증 (AIP)하이드록시메틸빌란 합성효소의 결핍하이드록시메틸빌란 신타제 및 포르포빌리노겐 데아미나제[ 43 ]
선천성 수크라제 -이소말타제 결핍증 (CSID)수크라제 및
이소말타제 결핍
사크로시다아제[ 44 ]
저인산염 결핍증알칼리성 포스파타제 (TNSALP)의 조직 비특이적 동종효소 결핍TNSALP [스트렌시크 ][ 45 ], (q)
단백질 C 결핍단백질 C 결핍단백질 C [세프로틴 ][ 46 ], (r)
유당불내증락타아제 -플로리진 가수분해효소의 활성 감소 또는 상실락타아제[ 47 ]
섬유증 상태
만성 완전 폐쇄관상동맥을 막는 섬유성 플라크콜라게나제 Clostridium histolyticum (CCH)[ 48 ]
듀피트렌병손의 근막 조직이 두꺼워짐콜라게나제 Clostridium histolyticum (CCH) [Xiapex][ 22 , 49 ], (들 )
페이로니병음경에 섬유질 플라크 형성콜라게나제 Clostridium histolyticum (CCH)[ 20 ]
자궁근종자궁 주변의 섬유종 조직 성장콜라게나제 Clostridium histolyticum (CCH)[ 50 ]
켈로이드 질환육아 흉터 조직의 과성장콜라게나제 및 매트릭스 메탈로펩티다제[ 51 , 52 ]
폐낭포성 섬유증폐의 비스코스 분비물디옥시리보뉴클레아제 I [풀모자임 ][ 21 ], (티 )
녹내장눈의 섬유주 에 있는 섬유질 형성콜라게나제[ 54 ]
안구 애정
유리체절제술로 치료되는 다양한 안 질환눈의 유리액 기능 장애를
효소 제거 로 해결
콘드로이티나제 , 히알루로니다제 , 나토키나제 및 오크리플라스민 [제트레아 ][ 55 ], (유 )
공동 문제
추간판
탈출증
척추경막을 관통하는 디스크 물질황산콘드로이틴 ABC 엔도리아제[ 56 ]
관절염골극 형성 및
염증
단백질 분해 효소[ 57 , 58 ]
암 의 종류종양 미세환경에서 아미노산 대사 증가PEG 화 아르기닌 데아미나제 및 키누레니나제 [Voraxaze, PEG 히알루로니다제 PH20][ 14 , 59 ], (v,w,x)
백혈병종양 미세환경에서 아미노산 대사 증가L-아스파라기나제 [Spectrila, Kidrolase, Erwinase, Oncaspar][ 16 , 59 ], (y,z)
화학요법으로 인한 고요산혈증종양용해증후군으로 인한 요산 증가요산산화효소 및 라스부리카제 [Fasturtec][ 60 ], (aa)
심혈관 질환
심혈관 질환플라스민에 의해 분해된 피브린 혈전 형성나토키나제 및 유로키나제 [Streptase, Syner-Kinase, Kinclytic, Rapilsyn,
Actilyse, Metalyse]
[ 17 ], (ab,ac,ad,ae,af)
세포외 기질 장애
화상괴사 조직의 변성 콜라겐콜라게나제 Clostridium histolyticum (CCH) [Nexobrid][ 63 , 64 ], (ag)
셀룰라이트진피 중격에 피하 콜라겐 축적콜라게나제[ 65 ]
활성산소종 손상
출혈성 쇼크 로 인한 장기 손상활성산소종 (ROS) 조직 손상과산화물 제거효소[ 66 ]
파킨슨병활성산소종 (ROS) 조직 손상나노자임 (PtCu 나노합금 )[ 68 ]
기타 애플리케이션
체강 질병글루텐 불내증글루텐 분해 효소[ 69 ]
미생물 감염감염 중 미생물 생물막 형성기질 분해 효소 (다당류 분해 효소 , 뉴클레아제 및 프로테아제 )[ 70 ]
염증생리적 항상성을 방해하는 과발현 경로의 염증단백질 분해 효소
(트립신 또는 세라티오펩티다제 )
[ 71 , 72 ]
코카인 과다 복용코카인 독성인간 부티릴콜린에스테라제 (BChE ) 또는
세균성 코카인 에스테라제 (CocE )
[ 73 ]

효소로 치료한 주요 병리 및 상태 요약.

* 괄호 안에는 효소의 상품명이 표시되어 있습니다. EMA가 승인한 효소 약물에 대한 소문자 참조, 해당 목록은 부록 A 에 자세히 나와 있습니다 .

Industrial Applications of Enzymes: Recent Advances, Techniques, and Outlooks

https://www.mdpi.com/2073-4344/8/6/238

효소의 산업적 응용: 최근 발전, 기술 및 전망

산업용 생체촉매로서의 효소는 지속 가능성 및 공정 효율성 측면에서 전통적인 화학 공정에 비해 많은 이점을 제공합니다. 효소 촉매작용은 제약, 식품 및 음료 산업의 상업적 공정을 위해 확장됐지만, 바이오 연료 생산과 천연가스 전환을 위한 에너지 부문의 최적 생체촉매 공정을 위해서는 안정성과 생체촉매 기능의 추가 향상이 필요합니다. 고정화 효소의 구현과 관련된 기술적 장벽은 이러한 산업 규모 공정에 적용할 수 있는 고정화 생체촉매의 개발을 위해서는 다 학문적 접근이 필요함을 시사합니다. 구체적으로는 효소고정화 분야의 기술적 전문성이 중복되어, 단백질 및 공정 공학은 차세대 고정형 생체촉매와 유도 공정의 성공적인 확장을 정의할 것입니다. 이 리뷰에서는 생체촉매가 어떻게 성공적으로 활용되었는지, 효소고정화가 산업 공정을 개선할 방법을 논의할 뿐만 아니라 시장 수익성을 최대화하고 물류 부담을 최소화하면서 제품 수율을 높이기 위해 효소 고정화의 다중 규모 구현에 중요한 분석 도구에 중점을 둡니다.

키워드:효소, 고정화, 산업 응용, 규모 확대, 기술경제적 분석, 수명주기

https://www.mdpi.com/catalysts/catalysts-08-00238/article_deploy/html/images/catalysts-08-00238-g001.png
https://www.mdpi.com/catalysts/catalysts-08-00238/article_deploy/html/images/catalysts-08-00238-g002.png
https://www.mdpi.com/catalysts/catalysts-08-00238/article_deploy/html/images/catalysts-08-00238-g004.png

결론

상업적 규모의 효소 촉매작용은 바이오연료 생산 및 천연가스 전환에 대한 최근 추세에 따라 제약 및 식품과 같은 여러 산업에서 구현되었습니다. 이러한 산업의 제품 수율은 더 온화한 공정 조건과 더 적은 에너지 소비, 폐기물 발생 감소, 탁월한 높은 제품 선택성에서 구현되는 효소 촉매 작용에 의해 제어되어 공정 경제성 및 환경 지속 가능성이 향상되는 것으로 나타났습니다. 그러나 효소 공정의 규모 확대는 생체촉매 안정성의 한계로 인해 크게 방해를 받습니다. 이를 위해 효소 촉매작용의 범위를 확대하고 공정 효율성을 향상하기 위한 매력적인 접근법으로 효소고정화가 제안되고 연구되었습니다. 최적의 효소 개발을 촉진하기 위해서는 고정화 전략에 대한 비판적인 조사가 여전히 필요하며, 상업적 규모의 공정에서 효소 촉매 작용 구현의 적절성을 위해서는 주변 공정 개발을 위한 경제적 원동력에 대한 전체적인 지식이 여전히 필요합니다. 차세대 고정화 생체촉매의 성공적인 산업적 적용은 궁극적으로 단백질 공학, 효소고정화, 프로세스 엔지니어링 및 수명주기 분석이 가장 중요합니다. 향후 구현 전망에서는 효소 수준과 고정화에 사용되는 플랫폼 모두에서 구조-기능 관계뿐만 아니라 낮은 구현 비용으로 최적화된 제품 수율과 통합 조합을 위한 실험 및 전산 접근 방식을 함께 고려해야 합니다.

Enzyme Immobilization Technologies and Industrial Applications

https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acsomega.2c07560#

효소 고정화 기술 및 산업 응용

효소는 다양한 산업 분야에서 중요한 역할을 하며 많은 산업 제품의 필수 구성 요소입니다. 고정화된 효소는 환경 변화에 대한 저항성이 더 높으며 유리 형태에 비해 쉽게 회수/재활용할 수 있습니다. 고정화의 주요 이점은 열악한 환경 조건(예: 상승된 온도, 극한 pH 값 등)으로부터 효소를 보호하는 것입니다. 고정화된 효소는 수처리장 이외에도 의료, 식품, 세제, 섬유, 제약산업 등 다양한 대규모 산업에 활용될 수 있다. 필요한 응용 분야에 따라 적합한 효소고정화 기술과 적합한 담체 재료가 선택됩니다. 효소고정화 기술에는 공유 결합, 캡슐화, 포착, 흡착 등이 포함됩니다. 이 검토에서는 주로 다양한 기술에 의한 효소고정화와 1992년부터 2022년까지 다양한 산업 응용 분야에서의 효소 활용을 다루고 있습니다. 또한, 특정 제품의 수율을 최대화하기 위한 고정화 효소의 다중 규모 작업에 중점을 둡니다. 마지막으로, 전 세계 효소 생산에 대한 코로나 19 대유행의 심각한 결과에 대해 간략하게 논의합니다.

https://pubs.acs.org/cms/10.1021/acsomega.2c07560/asset/images/medium/ao2c07560_0001.gif
https://pubs.acs.org/cms/10.1021/acsomega.2c07560/asset/images/medium/ao2c07560_0002.gif
https://pubs.acs.org/cms/10.1021/acsomega.2c07560/asset/images/medium/ao2c07560_0003.gif

결론

단백질 추출 기술의 발전과 단백질 공학의 새로운 발전으로 인해 향상된 특성을 보인 특정 효소를 능숙하게 제조할 수 있게 되었습니다. 바이오 촉매에 대한 수요는 많은 산업 분야에서 꾸준히 증가하고 있습니다. 화학 촉매보다 효소의 여러 장점으로 인해 거의 모든 산업 응용 분야에 유리한 대안이 됩니다. 효소고정화는 작동 안정성과 재사용성을 포함하여 여러 가지 경제적, 생태학적, 기술적 이점을 가지고 있습니다. 효소고정화는 생물학적 정화/수질 정화 외에도 식품, 제약, 동물 사료, 섬유, 의료, 세제 분야 등 다양한 산업 분야에 광범위하게 적용됩니다. 여러 효소는 다양한 전략을 사용하여 고정되고(예: 공유 결합 및 포획) 새로운 담체에 결합하고 다양한 대규모 공정에 사용됩니다. 새로운 고정화 전략을 개발할 여지가 여전히 남아 있습니다. 글로벌 효소 시장의 주요 동인은 주로 세제, 의약품, 섬유, 동물 사료, 바이오 연료와 화장품 제조업체의 환경친화적 대체품에 대한 높은 수요와 관련이 있습니다. 산업용 효소 시장은 지난 10년 동안 상당한 성장과 수익을 보였지만 2020년에는 코로나바이러스 전염병으로 인해 부정적인 영향을 받았습니다. 글로벌 공급망의 붕괴로 인해 지난 2년 동안 산업용 효소에 대한 수요가 급격히 감소했습니다. 고정된 형태의 효소는 가까운 미래에 더욱 일반적으로 적용될 것입니다.

추천도서

효소, 생명을 작동시키는 작지만 강한 분자기계, 폴 엥겔 저자(글) · 최가영 번역, 김영사 · 2023년 05월 08일

나는 부엌에서 과학의 모든 것을 배웠다, 화학부터 물리학 생리학 효소발효학까지 | 요리하는 과학자 이강민의 맛있는 과학수업

이강민 저자(글), 더숲 · 2017년 03월 17일

핵심 생화학(Stryer), John L. Tymoczko , Jeremy M. Berg , Gregory J. Gatto, Jr. , Lubert Stryer 저자(글) · 유진철 , 임정빈 외 번역, 범문에듀케이션 · 2021년 03월 02일

이해하기 쉬운 식품효소공학, 장판식 , 노봉수 , 유상호 , 김묘정 , 김영완 저자(글), 수학사 · 2017년 02월 27일 (1쇄 2010년 02월 15일)

유전공학의 이해, 남상욱 , 권혁빈 , 최선심 저자(글), 라이프사이언스 · 2016년 09월 01일

효소

https://simagebank.com/wp/599/